关键词:
CCDC141
肿瘤
预后
免疫微环境
泛癌分析
摘要:
目的:探讨在泛癌中细胞周期调节因子(CCDC)141基因表达特征及其与临床预后、肿瘤免疫浸润的关系。方法:通过分析癌症基因组图谱(TCGA)和基因型-组织表达数据库(GTEx),评估CCDC141 mRNA在肿瘤和正常组织中的表达差异,使用TIMER2.0和GEPIA2数据库进行进一步表达分析。利用UALCAN和人类蛋白质图谱(HPA)对CCDC141蛋白表达水平及其亚细胞定位进行评估,并结合Kaplan-Meier Plotter进行生存分析。利用cBioPortal分析CCDC141的突变特征,采用MethSurv进行DNA甲基化分析,使用TIMER2.0评估CCDC141表达与髓源性抑制细胞(MDSCs)浸润的相关性,并通过STRING和clusterProfiler进行基因富集分析。结果:CCDC141在多种肿瘤类型中[包括膀胱癌(BLCA)、乳腺癌(BRCA)、结肠癌(COAD)、肺鳞癌(LUSC)、肺腺癌(LUAD)]表达水平较低,而在肾透明细胞癌(KIRC)和急性髓系白血病(AML)中显著高表达,且与不良预后呈显著相关。细胞定位分析结果表明,CCDC141主要分布于细胞核内。肿瘤分期分析结果表明,在甲状腺癌(THCA)、BRCA、COAD、LUAD、LUSC和子宫内膜癌(UCEC)中,CCDC141表达水平显著低于正常组织(P<0.05),但早期和晚期肿瘤间无显著差异(P>0.05)。根据Kaplan-Meier分析结果,高表达组CCDC141与低表达组相比,在KIRC、宫颈鳞状细胞癌(CESC)、前列腺癌(PRAD)及LUAD中均与较好的总体生存期(OS)相关,而在LUSC和肾乳头状细胞癌(KIRP)中与较差的OS相关(P<0.05)。通过UALCAN数据库分析发现,CCDC141在BRCA、KIRC和LUAD的甲基化水平低于正常组织,可能导致这些肿瘤中CCDC141低表达。MethSurv分析显示,甲基化探针cg25205801在BRCA、KIRC和LUAD中的低甲基化状态与不良预后相关。CCDC141表达与髓源性抑制细胞(MDSCs)的浸润呈负相关,提示其在肿瘤免疫微环境中可能发挥重要作用。基因富集分析结果显示,CCDC141参与“神经元迁移”和“肌动蛋白结合”等通路,KIAA1755和PROKR2为CCDC141蛋白-蛋白相互作用网络中的HUB基因。结论:CCDC141作为一种新的泛癌生物标志物,可能在癌症的早期诊断和个体化治疗中具有重要应用潜力。